2019已走,总结我有

2019已经与我们擦肩而过,响应jimmy号召,把总结提前到这两天写好。一份总结,可以从多个方面入手,工作的、学习的(一般也和工作内容相关的)、生活的,主要写下学习方面的吧!

R语言和Python学习方面

想要入门一门编程语言真的要翻上好几本书才够,因为一本书的风格并不一定符合你的喜好和水平,可能读完了没有产生共鸣,提升不大。而且,只有把知识反复看,相当于复习才能初步掌握嘛。虽然不必要每本书都买回来,图书馆借来读下也是极好的。就拿今年的R语言学习来说吧,买来的《R语言实战》和之前的实战书系列读得不明不白,中间间隔时间又有点长,反而是讲量化投资的那本R语言书让我有点茅塞顿开的感觉。这里要说下技能树赠送的《生物信息学讲义》,R语言的知识点讲的清晰明了,再次加深了这种感觉。虽然对于R语言还是在门口徘徊,但坚定了继续翻几本书将入门进行到底的决心。

从年初开始学习Shiny,针对最近几年火热消费级基因检测,做了几个简单的小分析工具:我的shiny小站开发自己的TCGA数据库下载器就是怎么简单主要是把现成的R包(祖源的,HLA的等)加了个简单的界面,练了练手,最开心的是有人使用。

上半年,新浪相册停止服务了,新浪竟然只给一个包含全部相册网址的xml文件,不得不说,真没有大公司风范。于是,我为了批量下载里面的照片,用几行python代码实现了把xml文件里的照片批量下载,并共享了下:新浪相册下载小工具(方法应该已经过期了)。

工具方面:使用jupyter lab愉快地编程aspera(ascp)在mac和win下的使用命令整理

生物信息学习方面

由于工作是微生物相关的,持续地关注了qiime2的更新动态,并顺手翻译了下:qiime2更新笔记。还有一些关于qiime2的学习笔记:qiime2+picrust1学习笔记翻译]q2 picrust2 教程将QIIME2学习进行到底

跟着相关文献探索了一下Nanopore测序仪测16S的可行性和数据分析流程Nanopore 16S数据分析学习笔记,后面R10芯片更新了,决定继续追随技术进步的步伐追踪下去。

GWAS和多基因风险评分的学习才刚刚进步,还处于离门很远的阶段,需要加强学习。PRS多基因评分教程学习笔记

其余的便是工作中遇到的一些问题的解决和学习笔记了:

数字PCR学习笔记

2019年主流测序仪参数对比

纳米孔(Oxford Nanopore)测序仪的学习笔记

aspera要out了?

探索基因路漫漫–各种小特征

母系祖源之线粒体探寻

探索我的祖源

傻瓜宏基因组学之MetaPHIAN2学习笔记

回归分析的一些学习笔记

祖源分析学习笔记

PCA画图学习

ubiome数据分析流程学习笔记

生活方面

利用假期去了趟草原,感受了内蒙古中部草原的风光,欣赏下内蒙风光,顺便画了个大巴几千公里的行进路线图画个草原之旅路线图

还有两本书的读书笔记,《基因组–人类自传》读书笔记基因检测之《生命的语言》读书笔记
开始学习世界语,一门据说很简单的语言。学习了点音乐,单手弹奏玩具电子琴和吹口琴。在下半年开始每周六跑步两公里,锻炼一身体,努力走出亚健康。

“玩电脑”

在闲暇时光里,探索一下,各种不务正业,从app helloworld到给手机装个linux当电脑。

Android开发之HelloWorld

ios开发学习之swift-Hello World

树莓派刷openwrt作路由笔记

让你的手机变身电脑–我所知道的几种方式

安卓手机安装linux充当“生产力”的idea

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