数字PCR学习笔记

最近从南图借了本关于数字PCR的书,学习了下相关知识,了解了下数字pcr的行业情况,记个笔记备忘,同时分享一下所得。书名是《数字PCR–原理、技术和应用》,主编是彭年才,2017年出版的。

部分商用数字PCR系统比较

主要分为芯片式和微滴式两大类,分别有几个厂商。相对微滴式,芯片式反应单元偏少,芯片成本较高,但是防污染效果好些。这里直接把书中的表拍过来了。


数字PCR的相关知识

  • 1.最高精度在1.59分子/反应单元的时候;
  • 2.Vic和TAMRA荧光不能同时用,会相互干扰。
  • 3.Beacon Designer引物设计,ddPCRquant和Definetherain结果分析,后者开源。
  • 4.数字PCR的应用领域:
    1)基因表达分析
    2)基因突变检测
    3)甲基化水平检测

数字PCR的优缺点

1.优点:绝对定量,结果更灵敏、更稳定、更可靠。其本质是大规模平行单分子量级荧光PCR扩增,对NGS等获取的信息进行确认。
2.缺点:通量较低,最多96个样本一起,成本较高,单位时间产出处于劣势。

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