宏基因组学习笔记2

宏基因组研究的目的是通过对菌种(株)的鉴定,获得真实的多样性数据,功能,协作和进化。宏基因组分析的三个任务是物种分析(它们是谁),功能分析(能干什么,潜力),比较分析(怎么比较它们)。

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qiime2+biom+qiime1获得16S物种丰度

我们知道,不管是16S等扩增子测序,还是宏基因组,最后最重要的结果,就是物种的丰度情况了,qiime2给出的16S丰度结果是一个计数,对于许多软件来说这是可用的,那么如果我们想获得一个直接的百分比数据应该怎样做呢?

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