在阅读肺癌PRS分型那篇文章时发现作者使用这个软件进行了多元逻辑回归,值得学习一下。在微信上能找到一篇教程
这是一篇值得学习的文章,基本上全文翻译了这篇文章,觉得重要的地方进行了突出显示。
想要阅读这篇文章是因为《遗传风险评分的原理与方法》这篇论文里提到了,想要进一步了解OR-GRS这个方法,于是挑选部分翻译了下。
可以使用R将与通过应用C + T PRS方法(例如,使用PLINK或PRSice-2)获得的P值阈值范围相对应的PRS结果可视化
使用流行的遗传分析工具plink计算PRS-尽管plink不是专用的PRS软件,但是可以使用plink执行使用C + T标准方法计算PRS所需的每个步骤,并且可以执行此多步骤过程,是学习计算PRS的过程的好方法(通常由PRS软件自动执行)。
之前体验了一下[impute.me](http://www.impute.me/ “impute.me”)的基因检测分析服务,其内容之丰富和详尽让我感到吃惊。基本上涵盖了几乎所有有影响的GWAS研究结果(GWAS-Catalog等来源),于是我感到很好奇,他的评估计算方法,于是再次打开其开源的github地址,找到了一些内容,学习一下。再次为这个项目点赞!