最近偶然发现不管使用Maru OS(一个通过内置LXC后台运行实现安卓和linux共存的系统)和linux deploy(需要root),使用VNC监视器操作这个手机内置的linux操作系统,因为手机暂时没发现可以以有线网络连接电脑,所以延迟是比较严重的,延迟到几乎不能用的地步。当然,Maru OS在一台支持usb输出hdmi/VGA的手机上,可以直接输出到有线显示屏,这样延迟几乎没有了。估计现在技术的进步,无线投屏也是基本上延迟很小的,比如最近ipad-mac的sidebar。
激进的苹果总是先人一步的进行技术变革,从手机升级64位处理器,到抛弃32位软件。当然,也难免不能考虑工业生产环境的稳定性要求,导致基本上工业没有使用苹果软硬件的(这里特指那种连接机器的工控机等那些需要软件极其稳定的环境)。介于苹果的高冷,不允许别人染指他的利润,除去美国,在全世界只有百分之几的市场份额。
图形化生信分析是未来趋势,已经有多家公司开始开发生信分析的图形化解决方案,既有云计算,也有分析一体机,但是好像基本上都推广的不怎么成功。有其封闭性的原因,还有可能是售价太高,对一般公司来说不如多招个生信工程师更划得来,后者还能解决具体问题,比如软件运行过程中的报错,参数可变的个性化分析。
picrust2 beta既可以单独安装,也可以以qiime2-PICRUST2插件方式安装和使用,两者都可以在linux和Mac上运行,windows请使用虚拟机。
最近从南图借了本关于数字PCR的书,学习了下相关知识,了解了下数字pcr的行业情况,记个笔记备忘,同时分享一下所得。书名是《数字PCR–原理、技术和应用》,主编是彭年才,2017年出版的。
可以使用R将与通过应用C + T PRS方法(例如,使用PLINK或PRSice-2)获得的P值阈值范围相对应的PRS结果可视化
使用流行的遗传分析工具plink计算PRS-尽管plink不是专用的PRS软件,但是可以使用plink执行使用C + T标准方法计算PRS所需的每个步骤,并且可以执行此多步骤过程,是学习计算PRS的过程的好方法(通常由PRS软件自动执行)。
之前体验了一下[impute.me](http://www.impute.me/ “impute.me”)的基因检测分析服务,其内容之丰富和详尽让我感到吃惊。基本上涵盖了几乎所有有影响的GWAS研究结果(GWAS-Catalog等来源),于是我感到很好奇,他的评估计算方法,于是再次打开其开源的github地址,找到了一些内容,学习一下。再次为这个项目点赞!
之前学习了Base Data质控过程,下面继续,最近一直没有开启博客写作,十月将过,加紧补点。