到目前为止,我们已经完成了所有工作,并复制并粘贴了许多命令来完成所需的操作。这可行!但是也可能很耗时,并且更容易出错。接下来,我们将向你展示如何将所有这些命令放入Shell脚本中。
没事的时候,翻github,发现了qiime view网站的源代码是公开的,可以静态布署。手上有个云服务器,前几天又获得了一个免费域名qiime2.cn,于是做了一个镜像网站view.qiime2.cn,分享给需要的人。服务器在重庆,国内延时很小,打开完全速度稍慢,应该是服务器性能的原因,如果需要用这个功能,官方网站又打开特别慢的话,可以考虑下我这个镜像。
共生微生物的热生产是一种普遍现象,因为所有的动植物都含有丰富的微生物,所有微生物都会产生热量。微生物产生的热能与其他身体产的热结合,在温血动物中,温度将由良好的反馈系统控制。虽然微生物产生热能的重要性尚未得到研究,但其贡献可能具有深远的意义。它可以帮助温血动物避免低温在寒冷的气候是体温过低,并为冷血动物(外温动物)提高体温。在这方面,与生活在寒冷环境中的动物(可能也是人类)相比,在寒冷环境中进化是否选择了产生更多热量的微生物群,这将是有趣的。
最近在 肠道产业 微信公众号看到了这家公司的消息,之前一直是ubiome的消息,这反映了这样一个真理呀,行业老大的知名度才高,这老二老三知道的人就很少了。好像前面也了解过这家公司的一点信息,但是由于它是做健康生活方式管理 的,没怎么认真看。现在,趁着这个机会,学习一下这家公司的相关情况,做个笔记分享给大家。
没有一个微生物组是相同的,这就是为什么一个人的肠道健康不仅取决于微生物丰富度和多样性的数量,还取决于他们执行的独特功能的平衡。凭借Viome的20个肠道微生物组评分来衡量消化效率,蛋白质发酵,肠道屏障健康等,用户能够确定需要优化的功能,并发现最适合食用的食物,以达到并保持健康的平衡。
最近需要下载千人基因组计划中的中国人数据作为参考,于是学习了下几个下载方法。发现还是有几个小技巧值得分享的,就记录分享一下!我找到的主要方法有两三个,分别是通过网页下载,API批量下载和ftp批量下载。
在阅读肺癌PRS分型那篇文章时发现作者使用这个软件进行了多元逻辑回归,值得学习一下。在微信上能找到一篇教程
这是一篇值得学习的文章,基本上全文翻译了这篇文章,觉得重要的地方进行了突出显示。
想要阅读这篇文章是因为《遗传风险评分的原理与方法》这篇论文里提到了,想要进一步了解OR-GRS这个方法,于是挑选部分翻译了下。
QIIME 2 2020.2 更新踩着2月的尾巴来了!疫情仍在,学习的好时光呀,加油!这次更新有一些小的命令更改,已经把需要关注的重点更新突出显示。官方提醒下一次的更新发布是QIIME 2 2020.5,请持续关注更新。