有个小插曲，是这个软件的名字我竟然搞错了…
宏基因组分析，首先需要的结果是获得物种分类信息，前面我们提到，宏基因组有两种分析方式分别是基于序列比对和组装的，组装对电脑硬件的要求是超级高的，不过比对，就轻松多了，得益于算法的优化，有的软件可以实现在个人电脑上进行分析。最近的“AMD YES”也很给力，把普通个人电脑推向了8核16G RAM这种配置，终于追上了手机（虽然二者性能不可同日而语）。算力有了，充分利用起来呀，来个宏基因组玩玩呀！
生活中，你一定对酸奶不陌生，早在古时候先辈们已经制作酸奶了。在中国，酸奶有史可查的最早记录是在公元5世纪，贾思勰在《齐民要术》中记载了齐地酸奶的制作方法。而酸奶中最常见的几种菌就是保加利亚乳杆菌、嗜热链球菌、乳酸乳球菌等了。
最近在 肠道产业 微信公众号看到了这家公司的消息，之前一直是ubiome的消息，这反映了这样一个真理呀，行业老大的知名度才高，这老二老三知道的人就很少了。好像前面也了解过这家公司的一点信息，但是由于它是做健康生活方式管理 的，没怎么认真看。现在，趁着这个机会，学习一下这家公司的相关情况，做个笔记分享给大家。
没有一个微生物组是相同的，这就是为什么一个人的肠道健康不仅取决于微生物丰富度和多样性的数量，还取决于他们执行的独特功能的平衡。凭借Viome的20个肠道微生物组评分来衡量消化效率，蛋白质发酵，肠道屏障健康等，用户能够确定需要优化的功能，并发现最适合食用的食物，以达到并保持健康的平衡。
越来越多的证据表明，肠道微生物与人类CRC的发展有关。对肠道微生物的全面表征对于评估其作为CRC早期诊断标记物的潜力是非常重要的。在这篇综述中，我们总结了CRC相关细菌及其在动物模型、人类细胞系和人类队列中的致癌机制的最新研究。高通量测序技术促进了人类样本中CRC相关细菌的鉴定。
1900年Landsteiner首先认识到ABO血型系统的存在。从那时起，ABO系统的抗原(分别是A，B和H决定簇)被证明包含复杂的碳水化合物结构。通过糖基转移酶的顺序作用合成A和B抗原，A和B糖基转移酶分别催化N-乙酰半乳糖胺和D-半乳糖加成前体H抗原。O组个体缺乏这样的转移酶，仅表达基本的H结构。每个红细胞上大约有200万个ABH糖链抗原位点。此外，ABH抗原在其他人类细胞和组织中广泛表达，包括感觉神经元、上皮细胞、血管内皮和血小板。
硫代谢微生物将膳食中来源的硫转化为有遗传毒性的硫化氢(H2S)，与结直肠癌(CRC)的发生有关。我们确定了一种与粪便中硫代谢菌相关的饮食模式，然后利用一项大型前瞻性男性研究的数据，调查其与CRC发病风险的关系。
这篇文章这会拿出来重读是因为，我发现有公司以这篇文章的方法做成了一个肠癌早筛产品，就是前段时间发布的以检测7种菌来进行肠癌早筛的产品。不小心找到了这个公司的专利，结合这篇文章一起学习一下。
这是一篇2015年发表在cell上的文章，虽然有点老，但是研究的内容依然具有参考价值，这里仔细读了一遍，分享一下！