发现自己还是比较菜的，不能在qiime2的结果文件里进行较好的操作来达到获得各种属相对丰度的表，于是决定把数据导出到biom和txt格式来进行后续操作。这样就可以利用qiime2的新算法的优势，和之前已有的宏基因组公众号上介绍的流程来进行后续操作。毕竟，对于16S扩增子分析最重要的就是获得物种分类丰度信息。
qiime2-2019.1已经发布，程序稳定性越来越好，鉴于官方已经停止支持qiime1，有必要把qiime2的所有细节都理清，学好，这样才能对自己的数据进行实战分析，并将结果运用于实验和生产过程中。发现文档更新也相当快，感谢公众号宏基因组翻译的文档，让我在看许多专业术语方面扫清不少障碍，但是你介于翻译过来的命令却已经过时，还是对照着看最新版的，基本上很少改动，当然，专业英语好的除外。
QIIME2 2019.1发布啦，继续紧跟步伐，看看更新了哪些内容，一并备忘。
这个发布生版本主要针对更新依赖环境，升级到了Python 3.6，一个新的 r-vegan Adonis visualizer，修复了一些小bugs，虚拟机镜像和新的预训练分类器立马可得。
1.qiime1 1.1 给分好的序列改…
qiime2正在从一个单纯的marker gene分析软件向代谢组学和基因组学发展，并且，正逐步形成一个生态系统，方便任何开发者为之开发插件。.qza和.qzv其实是标准的zip格式，可以方便解压得到数据，和之前一直以为的qiime2是封闭的，不让人把数据解开的印象完全不一样嘛。
qiime2又双叒叕更新了，看看这次带来什么新的特性，保持关注才能不落伍，内容翻译自qiime2论坛。赶快快乐qiiming吧。
所谓“书到用时方恨少，绝知此事要躬行”，手上拿到测序数据才深深地感受到了这一点，本来以为挺简单的问题，具体针对这个项目又有小难题挡路，于是读教程，读文档，抓紧搞定。
qiime1已经不更新的维护，虽然可以使用，毕竟已经有点过时。学习qiime2还是相当必要的，毕竟它是趋势。但qiime2更新是如此迅速，以至于许多翻译成中文的教程不少命令已然过时了，所以有必要学习一下两个月一更新的qiime究竟在命令上有哪些大的更改。
最近在github上找到一个ubiome的原始数据，包含多个身体部位的，尝试分析一下，看看能获得什么结果。经历了那么多的安装坑，发现还是docker的安装方式最方便有效、节省时间，特别是换上国内的加速源之后。虚拟机太占资源，而且总感觉虚拟机不够真实，conda安装完竟然也总是报错，特别是更新2个月一次如此频繁的qiime2。
最近有点好奇，仅次于qiime的Mothur，用起来感觉如何，于是决定尝试下。虽然qiime还没有学会学透，但人活着就要折腾嘛，否则与咸鱼有什么区别，哈哈。