1.qiime1 1.1 给分好的序列改…
qiime2正在从一个单纯的marker gene分析软件向代谢组学和基因组学发展,并且,正逐步形成一个生态系统,方便任何开发者为之开发插件。.qza和.qzv其实是标准的zip格式,可以方便解压得到数据,和之前一直以为的qiime2是封闭的,不让人把数据解开的印象完全不一样嘛。
qiime2又双叒叕更新了,看看这次带来什么新的特性,保持关注才能不落伍,内容翻译自qiime2论坛。赶快快乐qiiming吧。
消费级基因检测依然如火如荼,刚过去的双11有公司销售额过百万,算下来是当天购买人数在几千人左右。手上有SNP芯片数据,想要获得更多感兴趣的位点怎么办,刚发现了一个神奇的网站,可以满足你的部分好奇心。https://www.impute.me/
最近从图书馆借了《生物信息学(第2版)》国防科大刘伟主编的,继续我的学习之路。我是图书馆有啥新书就借来读读,一来比较喜欢新书,二来这书好像也不怎么热,能借得到,虽然好多内容是重复,也有新东西可学的快感,顺便复习一下也不错。这次,我看到了weka,学习一下!
linux备忘笔记,主要是学习工作过程中用到的相关命令,省得以后再百度,先放在这里备忘。最近对arch和gentoo比较感兴趣,也加了两条,持续收集和记录。
在我的理解里,halium是uports社区为ubuntu touch等而建立的一个项目。我认为就是社区版的ubuntu touch,尽管官方已经放弃了这个系统,这个系统也由于小众和缺少app,处于和sailfish os,tizen os和已经被放弃的firefox os一样的境地,但是,有一点不同的是,ubuntu touch 致力于安卓高端手机上成为潮流的连接上显示器就是一台桌面终端的主机的功能。应用也可以通用,从这点来看,如果哪天谷歌对安卓系统收费,或者过渡到其新的系统的路不顺利,ubuntu touch还是有取而代之的希望的。
所谓“书到用时方恨少,绝知此事要躬行”,手上拿到测序数据才深深地感受到了这一点,本来以为挺简单的问题,具体针对这个项目又有小难题挡路,于是读教程,读文档,抓紧搞定。
肠道微生物还是很热,最近发现南图里有本畅销书是关于此的,一看还是今年出版的,决定拿来读一读。庆祝博客搬迁到了腾讯云,香港的机房,网速还是挺不错的,从美国东部200ms的延迟变为现在的50。换了个主题庆祝下。
最近一直用腾讯翻译君翻译部分文字,觉得这个系统挺好用的,感觉准确度不错,但是复制的文字总是每一行认为是一段,于是写了个小脚本来解决。顺便找到了腾讯翻译君现成的Python,用起来很开心。