越来越多的证据表明，肠道微生物与人类CRC的发展有关。对肠道微生物的全面表征对于评估其作为CRC早期诊断标记物的潜力是非常重要的。在这篇综述中，我们总结了CRC相关细菌及其在动物模型、人类细胞系和人类队列中的致癌机制的最新研究。高通量测序技术促进了人类样本中CRC相关细菌的鉴定。
1900年Landsteiner首先认识到ABO血型系统的存在。从那时起，ABO系统的抗原(分别是A，B和H决定簇)被证明包含复杂的碳水化合物结构。通过糖基转移酶的顺序作用合成A和B抗原，A和B糖基转移酶分别催化N-乙酰半乳糖胺和D-半乳糖加成前体H抗原。O组个体缺乏这样的转移酶，仅表达基本的H结构。每个红细胞上大约有200万个ABH糖链抗原位点。此外，ABH抗原在其他人类细胞和组织中广泛表达，包括感觉神经元、上皮细胞、血管内皮和血小板。
硫代谢微生物将膳食中来源的硫转化为有遗传毒性的硫化氢(H2S)，与结直肠癌(CRC)的发生有关。我们确定了一种与粪便中硫代谢菌相关的饮食模式，然后利用一项大型前瞻性男性研究的数据，调查其与CRC发病风险的关系。
为了调查全基因组水平的致病基因和变异的价值和临床影响，我们使用了一项前瞻性队列研究设计，招募了同意对其全基因组进行测序并使用临床实验室测试、代谢组学技术和先进的非侵入性成像参与深度表型分析的志愿者。基因组结果与表型结果相结合。
癌症易感性基因检测对于可能从乳腺癌、卵巢癌和直肠癌的筛查、预防和早期检测中获益的个体是有用的，并且可能对处于胰腺癌风险中的个体有益。家族成员中有易感性基因突变的，也可能受益于增强的癌症筛查和预防策略。
世卫组织已经将新冠状病毒2019-nCov重全名为COVID-19，所以与时俱进，我们也叫COVID-19。今天看下它的检测方法，整体来看，应该说还没有十全十美的解决方案，只能两个或者多个方案联用。
前面做的许多处理基本上自己拼凑来的，下面再看下完整解决方案。researchgate网站上有人说qiime1版本有这个双向数据配对不拼接的选项？这个没找到。主要发现了有两个方案，一个是有篇文章提出了一个流程*Hybrid-denovo*，还有一篇peer review的文章，几个人评议还有一个人不同意，anyway，都看下。
最近这波疫情，重现当年初中非典时期，甚至愈演愈烈，与之前初中时的封校住宿学习不同，已经工作的今天和太多的互联网信息大爆炸让我们有些焦虑，特别是，作为学习生物的人，我们也感到无能为力。官方媒体的科普，已经让大家对这个病毒的具体情况有所了解。我注意到，NJEM也已经把许多文章翻译成了中文版，以正视听。在这个时候，我们不能听信谣言！那么作为有些生物学素养的我们，也应该以自己的知识，学习下这个病毒的信息，以我们自己的理解！
接着前面的内容，这里再进行下数据库的处理，看看从参考数据库就按测序数据处理是不是能提高物种注释的精度。这里先预报一下，种的分类结果并不能有明显的提升，或许是因为序列长度的缺陷，即使再努力提高技巧，终究不能解决根本的问题，250bp的长度，对比1500bp左右的全长，显然还是太短了，难以实现精确的分类，所以，要想更精确，只有上16S全长，这只能寄望于Pacbio，Oxford Nanopore，和10x linked reads或者类似的技术，比如华大的sLtFR等技术提升读长了。再激进些，等测序成本足够低，上宏基因组，宏转录组了。