picrust2 beta既可以单独安装，也可以以qiime2-PICRUST2插件方式安装和使用，两者都可以在linux和Mac上运行，windows请使用虚拟机。
最近从南图借了本关于数字PCR的书，学习了下相关知识，了解了下数字pcr的行业情况，记个笔记备忘，同时分享一下所得。书名是《数字PCR–原理、技术和应用》，主编是彭年才，2017年出版的。
可以使用R将与通过应用C + T PRS方法（例如，使用PLINK或PRSice-2）获得的P值阈值范围相对应的PRS结果可视化
使用流行的遗传分析工具plink计算PRS-尽管plink不是专用的PRS软件，但是可以使用plink执行使用C + T标准方法计算PRS所需的每个步骤，并且可以执行此多步骤过程,是学习计算PRS的过程的好方法（通常由PRS软件自动执行）。
之前体验了一下[impute.me](http://www.impute.me/ “impute.me”)的基因检测分析服务，其内容之丰富和详尽让我感到吃惊。基本上涵盖了几乎所有有影响的GWAS研究结果（GWAS-Catalog等来源），于是我感到很好奇，他的评估计算方法，于是再次打开其开源的github地址，找到了一些内容，学习一下。再次为这个项目点赞！
之前学习了Base Data质控过程，下面继续，最近一直没有开启博客写作，十月将过，加紧补点。
最近发现生信技能树VIP论坛群里在讨论jupyter lab这么一个工具，内心想尝试一下，毕竟一个好工具或许就可以改变你的学习态度和进程，工欲善其事，必先利其器嘛。我使用了这个工具之后，感觉又重新燃起了对R语言的学习热情呢。当然，手上的技能树讲义讲得好也至关重要。下面就说说我安装使用这个工具遇到的一点问题和解决的过程。
最近发现PRS是近两年比较热门的领域，从科学家对糖尿病等几种疾病的评分，到23andme对糖尿病的评估，发表的文章也越来越多，有必要学习一下他的基本过程。这里找到了一个比较详细的教程，学习和记录一下。教程是一个毕业于香港大学的博士写的，还是PRS分析软件PRSice-2的作者之一，地址放在这：https://choishingwan.github.io/PRS-Tutorial/ 。这篇教程是以同作者发表在生物预印本上的一篇文章为蓝本写的，教程更加详细，示例数据和步骤详尽，可以保证每个人从头重复到尾，而且分别介绍了三种方法的使用，值得学习一下。教程需要R语言和plink，以及LDpred和lassosum软件。
幽门螺杆菌是一个令许多国人谈之色变的话题，特别是当它被证实是一个较强的致癌因子之后。今天，我们对它的认识在加深，只有caga毒力基因阳性的菌株才有强致癌性，而且，身体里有幽门螺杆菌的人，还被发现不容易过敏和胃食管返流。所以，现在普遍认为，只有毒力基因检出时才有必要根除。还有研究发现幽门螺杆菌的易感性与个体的基因有关。