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想要阅读这篇文章是因为《遗传风险评分的原理与方法》这篇论文里提到了，想要进一步了解OR-GRS这个方法，于是挑选部分翻译了下。
QIIME 2 2020.2 更新踩着2月的尾巴来了！疫情仍在，学习的好时光呀，加油！这次更新有一些小的命令更改，已经把需要关注的重点更新突出显示。官方提醒下一次的更新发布是QIIME 2 2020.5，请持续关注更新。
越来越多的证据表明，肠道微生物与人类CRC的发展有关。对肠道微生物的全面表征对于评估其作为CRC早期诊断标记物的潜力是非常重要的。在这篇综述中，我们总结了CRC相关细菌及其在动物模型、人类细胞系和人类队列中的致癌机制的最新研究。高通量测序技术促进了人类样本中CRC相关细菌的鉴定。
1900年Landsteiner首先认识到ABO血型系统的存在。从那时起，ABO系统的抗原(分别是A，B和H决定簇)被证明包含复杂的碳水化合物结构。通过糖基转移酶的顺序作用合成A和B抗原，A和B糖基转移酶分别催化N-乙酰半乳糖胺和D-半乳糖加成前体H抗原。O组个体缺乏这样的转移酶，仅表达基本的H结构。每个红细胞上大约有200万个ABH糖链抗原位点。此外，ABH抗原在其他人类细胞和组织中广泛表达，包括感觉神经元、上皮细胞、血管内皮和血小板。
硫代谢微生物将膳食中来源的硫转化为有遗传毒性的硫化氢(H2S)，与结直肠癌(CRC)的发生有关。我们确定了一种与粪便中硫代谢菌相关的饮食模式，然后利用一项大型前瞻性男性研究的数据，调查其与CRC发病风险的关系。
为了调查全基因组水平的致病基因和变异的价值和临床影响，我们使用了一项前瞻性队列研究设计，招募了同意对其全基因组进行测序并使用临床实验室测试、代谢组学技术和先进的非侵入性成像参与深度表型分析的志愿者。基因组结果与表型结果相结合。
癌症易感性基因检测对于可能从乳腺癌、卵巢癌和直肠癌的筛查、预防和早期检测中获益的个体是有用的，并且可能对处于胰腺癌风险中的个体有益。家族成员中有易感性基因突变的，也可能受益于增强的癌症筛查和预防策略。
世卫组织已经将新冠状病毒2019-nCov重全名为COVID-19，所以与时俱进，我们也叫COVID-19。今天看下它的检测方法，整体来看，应该说还没有十全十美的解决方案，只能两个或者多个方案联用。
前面做的许多处理基本上自己拼凑来的，下面再看下完整解决方案。researchgate网站上有人说qiime1版本有这个双向数据配对不拼接的选项？这个没找到。主要发现了有两个方案，一个是有篇文章提出了一个流程*Hybrid-denovo*，还有一篇peer review的文章，几个人评议还有一个人不同意，anyway，都看下。