全球生物样本库荟萃分析倡议 (GBMI)+整理的一个github的repo

29 个具有不同起源和祖先的生物样本库和倡议已加入 GBMI

全球生物样本库荟萃分析计划[1]

全球生物样本库荟萃分析倡议 (GBMI) 旨在创建一个框架,以启动全球生物样本库和倡议合作。这个简单框架的好处包括但不限于:

• 为全基因组关联研究 (GWAS)提供更好的功效 

• 更准确的多基因风险评分 

• 未充分研究的疾病的 GWAS 

• 交叉验证的机会 

• 精细映射的改进 

• 探索亚组分析的潜力

旗舰项目

我们对多达 18 个生物样本库的 14 个终点进行了基于逆方差的 meta 分析。所有分析摘要统计信息均可从以下链接获得。

  • 表型清单(在  Google 表格[2]上浏览)包含汇总统计文件的位置和详细信息(全生物样本库荟萃分析,按性别和血统群体分层,包括至少两个生物样本库)

  • Pheweb 链接[3]

  • 使用全生物样本库多血统荟萃分析和省略 UKBB 多血统荟萃分析估计的 PRS 权重已存放在研究[4] ID 为 PGP000262 (https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/)[5])  的 PGS 目录中

看了下是只能查看,不能下载全部summary statistics的,不过可以下载显著位点的表格,也不错!

Biobanks_summary_statistics[6]

这是我最近收集的一个可用的 PheWeb 网站和生物样本库项目,在以下文件中列出:

Datasets.md [7]生物样本库 summary_statistics

Imputation_refer_server.md[8]  填充参考面板和服务器,包括 HLA

欢迎一起完善和丰富!

提前祝大家新年快乐!

参考资料

[1]

全球生物样本库荟萃分析计划: http://results.globalbiobankmeta.org/

[2]

Google 表格: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1sSU_JfPKs6EZLcY9t3gXsSGPZA1LsP_z/edit?usp=sharing&ouid=100644620191323357252&rtpof=true&sd=true

[3]

Pheweb链接: http://results.globalbiobankmeta.org/

[4]

研究: https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/

[5]

https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/): https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/

[6]

Biobanks_summary_statistics: https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics

[7]

Datasets.md : https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics/blob/main/Datasets.md

[8]

Imputation_refer_server.md: https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics/blob/main/Imputation_refer_server.md


本篇文章来源于微信公众号:微因

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