29 个具有不同起源和祖先的生物样本库和倡议已加入 GBMI
全球生物样本库荟萃分析计划[1]
全球生物样本库荟萃分析倡议 (GBMI) 旨在创建一个框架,以启动全球生物样本库和倡议合作。这个简单框架的好处包括但不限于:
• 为全基因组关联研究 (GWAS)提供更好的功效
• 更准确的多基因风险评分
• 未充分研究的疾病的 GWAS
• 交叉验证的机会
• 精细映射的改进
• 探索亚组分析的潜力
旗舰项目
我们对多达 18 个生物样本库的 14 个终点进行了基于逆方差的 meta 分析。所有分析摘要统计信息均可从以下链接获得。
-
表型清单(在 Google 表格[2]上浏览)包含汇总统计文件的位置和详细信息(全生物样本库荟萃分析,按性别和血统群体分层,包括至少两个生物样本库)
-
Pheweb 链接[3]
-
使用全生物样本库多血统荟萃分析和省略 UKBB 多血统荟萃分析估计的 PRS 权重已存放在研究[4] ID 为 PGP000262 (https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/)[5]) 的 PGS 目录中
看了下是只能查看,不能下载全部summary statistics的,不过可以下载显著位点的表格,也不错!
Biobanks_summary_statistics[6]
这是我最近收集的一个可用的 PheWeb 网站和生物样本库项目,在以下文件中列出:
Datasets.md [7]生物样本库 summary_statistics
Imputation_refer_server.md[8] 填充参考面板和服务器,包括 HLA
欢迎一起完善和丰富!
提前祝大家新年快乐!
参考资料
全球生物样本库荟萃分析计划: http://results.globalbiobankmeta.org/
[2]Google 表格: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1sSU_JfPKs6EZLcY9t3gXsSGPZA1LsP_z/edit?usp=sharing&ouid=100644620191323357252&rtpof=true&sd=true
[3]Pheweb链接: http://results.globalbiobankmeta.org/
[4]研究: https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/
[5]https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/): https://www.pgscatalog.org/publication/PGP000262/
[6]Biobanks_summary_statistics: https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics
[7]Datasets.md : https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics/blob/main/Datasets.md
[8]Imputation_refer_server.md: https://github.com/zd200572/Biobanks_summary_statistics/blob/main/Imputation_refer_server.md
本篇文章来源于微信公众号:微因