1.Feature表统计 继续我的qii…
把fastq和fastq.gz数据放在工作文件夹q2studio并不识别,也可能是我的文件命名规律不符合软件的识别规律,不管怎样,为了尝试下图形界面,还是把数据导入qiime做成qza格式试试吧,有点无奈,还是回到了命令行。这个按我上次的那个python脚本解决,https://jiawen.zd200572.com/278.html 。
在装好了q2studio后很困惑,所有的插件都是灰色的,即使切换到有数据的文件夹,一直以为是我的报错($JAVA_HOME找不到)导致的。由于报错,我还尝试了好几个版本进行测试,可是悲剧的是都有问题,于是祭出杀手锏,上虚拟机了哈哈。比conda还要简单,当然性能也就相对差点了。先运行起来学会再说。于是尝试先试试官方给的那个例子,理解一下是个什么原理。
自从知道了qiime2有了图形界面,一直期待自己能安装测试一下,无奈安装了ubuntu和debian两个linux发行版都在npm安装包的过程中报错失败了,看官网的截图是ubuntu的,我却没有成功。于是我总觉得我的黑果应该可以安装成功。
selenium是一个控制浏览器的模块,66的,挺酷的感觉。我在《python编程快速上手–让繁琐工作自动化(Automate the Boring Stuff with Python)》中读到了这个模块,想试试,却发现问题是不管用哪个浏览器,都会报类似的错误
好长时间没有使用自己蹩脚的技术写个小爬虫做点事情了,刚好,发现一个小说网站,当然,我对小说内容没有兴趣,只是随便找了本小说,爬爬测试。
1.LA(N)MP
这是最重要的嘛,做一个展示窗口,也就是现在看到的网站,wordpress傻瓜式建站,你也可以拥有。写个博客大概相当于QQ空间一样简单了。再加个插件变成app和小程序一样简单,开源的力量是伟大的,拥抱开源,拥抱技术。
今天决定进行一次拖了许久的网站备份工作,虽然我的网站的东西都在其他网站备份过了,但是备份一下还是必要的,万一哪天不小心自己把服务器搞崩溃了,没有备份就只有哭了。备份竟然出了点小差池,也是醉了。。。
者列举了一系列数字来说明暴力一直在减少,然后回顾了历史上那些残酷的事件,刑罚和暴行。比如,最早的奴隶制度,各种惨无人道的刑罚,包括凌迟之类的,还有把人订在十字架上。还有,许多书籍中也有暴力的影子,比如圣经中,还有安徒生童话中的几篇。各种大屠杀,特别是战争的时候,南京大屠杀,纳粹大屠杀,甚至近年的卢旺达大屠杀等等。
导入数据之后便是质控了。
这次不用测试数据了,用实际数据跑一下,所以同样重复之前的步骤,把fastq文件压缩下,然后,生成样本数据列表(ps.不知道fastq文件不压缩可不可以用,有空试下)。