肠道内大约有1000-1500种细菌,每个个体有160种左右的优势种。肠道菌群在人一生中分三个阶段:婴幼儿快速变化期,成人稳定期和老年退化期。
由安吉莉娜·茱莉助推的基因检测仍在持续火热,蓝海逐步成为红海。而早就有人把目光投向了肠道微生物群的检测,最近一段时间ncs的接力发表足以说明它的火热,检测公司国外有ubiome等,国内也有多家公司进行这个检测。下面,我们来管中窥豹,看看几个检测方法的比较,只说我用搜索引擎找到的公司,无任何偏好性。
1.Feature表统计 继续我的qii…
把fastq和fastq.gz数据放在工作文件夹q2studio并不识别,也可能是我的文件命名规律不符合软件的识别规律,不管怎样,为了尝试下图形界面,还是把数据导入qiime做成qza格式试试吧,有点无奈,还是回到了命令行。这个按我上次的那个python脚本解决,https://jiawen.zd200572.com/278.html 。
在装好了q2studio后很困惑,所有的插件都是灰色的,即使切换到有数据的文件夹,一直以为是我的报错($JAVA_HOME找不到)导致的。由于报错,我还尝试了好几个版本进行测试,可是悲剧的是都有问题,于是祭出杀手锏,上虚拟机了哈哈。比conda还要简单,当然性能也就相对差点了。先运行起来学会再说。于是尝试先试试官方给的那个例子,理解一下是个什么原理。
自从知道了qiime2有了图形界面,一直期待自己能安装测试一下,无奈安装了ubuntu和debian两个linux发行版都在npm安装包的过程中报错失败了,看官网的截图是ubuntu的,我却没有成功。于是我总觉得我的黑果应该可以安装成功。
selenium是一个控制浏览器的模块,66的,挺酷的感觉。我在《python编程快速上手–让繁琐工作自动化(Automate the Boring Stuff with Python)》中读到了这个模块,想试试,却发现问题是不管用哪个浏览器,都会报类似的错误
好长时间没有使用自己蹩脚的技术写个小爬虫做点事情了,刚好,发现一个小说网站,当然,我对小说内容没有兴趣,只是随便找了本小说,爬爬测试。
1.LA(N)MP
这是最重要的嘛,做一个展示窗口,也就是现在看到的网站,wordpress傻瓜式建站,你也可以拥有。写个博客大概相当于QQ空间一样简单了。再加个插件变成app和小程序一样简单,开源的力量是伟大的,拥抱开源,拥抱技术。
今天决定进行一次拖了许久的网站备份工作,虽然我的网站的东西都在其他网站备份过了,但是备份一下还是必要的,万一哪天不小心自己把服务器搞崩溃了,没有备份就只有哭了。备份竟然出了点小差池,也是醉了。。。