qiime2图形界面版(q2studio)学习笔记三

把fastq和fastq.gz数据放在工作文件夹q2studio并不识别,也可能是我的文件命名规律不符合软件的识别规律,不管怎样,为了尝试下图形界面,还是把数据导入qiime做成qza格式试试吧,有点无奈,还是回到了命令行。这个按我上次的那个python脚本解决,https://jiawen.zd200572.com/278.html 。

继续阅读 →

qiime2图形界面学习笔记二

在装好了q2studio后很困惑,所有的插件都是灰色的,即使切换到有数据的文件夹,一直以为是我的报错($JAVA_HOME找不到)导致的。由于报错,我还尝试了好几个版本进行测试,可是悲剧的是都有问题,于是祭出杀手锏,上虚拟机了哈哈。比conda还要简单,当然性能也就相对差点了。先运行起来学会再说。于是尝试先试试官方给的那个例子,理解一下是个什么原理。

继续阅读 →