一直迷惑于如何把qiime2和picrust结合起来用来分析16S的数据，直到这两天，看到了微生太公众号的视频教程，才有了眉目，原来如此。详细视频教程可以查找相关公众号获得。前面看到picrust2已经处于beta状态了，其可以嵌入于qiime2中，使用更方便，可是我的试用结果却差强人意，或许是我的使用过程有问题。之前使用picrust1网页版（Glaxy平台，不是三星的那个，是个生物信息云平台软件系统）分析的效果还可以，于是决定用picrust1再试试。
尝试再现Nano-Ampli文章的数据分析过程，由于原始数据不完整，可能有参数没列出等原因，没有成功再现出结果，理了理流程，欢迎大家指正，交流。
q2cli 1.在查看插件的详细信息时清…
对于一个不提供太多分析，而可以提供原始数…
作者提到了在国外几个较早的肠道菌检测机构和平台，美国肠道计划AGP，uBiome，Atlasbiomed，这三家，是西方人能做的其中几个。
然后，作者强调了HLA的重要性，举了几个例子，如类风湿，与Prophyromonas(拟杆菌门)相关。强直性脊柱炎与HLA-B27的关系，与Kleibsiella菌属感染有关。多发性硬化症，疲劳综合征与支原体；莱姆病与包柔氏螺旋体相关，HLA-DR15,16可抵抗。HLA-DR4可抵抗沟鞭藻类的感染，其他的还有比如23andme把HLA分型用于预测牛皮癣的概率。
插句题外话，如果你有snp芯片的原始数据，可以娱乐性的帮你分出你的HLA型，准确率不够高，但是也能用了。地址在这：https://jiawen.zd200572.com/hla/HLA%E5%88%86%E5%9E%8B%E5%99%A81.html
最近生信技能树抽奖，中了一个基因检测试剂盒，挺开心的，给我老婆检测了一下，恭喜她成为我们家第一个有基因检测数据的人，感谢陕西图灵生物的奖品。检测是采用消费级基因检测常用的snp芯片，60万位点，拿到的结果大概有13M左右的样子。
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