q2cli 1.在查看插件的详细信息时清…
对于一个不提供太多分析，而可以提供原始数…
大概对许多人来说，基因检测很大一部分是检测一下自己的祖源，这样想更多的知道自己生物学意义上来自哪里，基因是不会说慌的。当然，从家谱上是可以看到姓氏来自哪里，如果有数千年不间断的族谱的话，你可以知道你的姓氏来自哪里，尽管可能有过继等的存在。
最近觉得半瓶醋的16S数据分析可以继续进…
这两天在用mac下载ena的fastq数据，发现aspera connect，windows和mac版本的死活不会用呢，于是就学习了一下，发现一样是可以使用命令行的，这里是mac的，后面再整理下win的。
最近工作用到了一些回归分析方面的知识，整理一下，放在这里备忘。主要是简单的多元线性回归和分位数回归两种，基本上都只需要几个R语言命令就能解决了。
再来看看第二个项目，同样有惊人地数不清的数目，竟然有339个项目之多，同样覆盖了好多不同的领域，很多还是各种生活特征，充满了趣味性的感觉。同样还是和GWAS计算器一样的，是根据每一篇文章来的，后面是附上了各个位点和等位基因频率等相关系数。
除了祖上有不间断的详细族谱的人（这毕竟是少数大家望族才能有的待遇），想必每个人都会对自己的祖上来自哪里充满了好奇，这也是许多人做基因检测的主要目的，探索未知是人类的天性，于是我来探索以下祖源是怎么得出来的。
一直一来，很好奇祖源分析是怎么做的，还尝试过使用一款SPA（Spatial Ancestry analysis）这个软件尝试进行分析，结果差强人意，祖源定位地点总是在海上。。。（在搜索基因型填充时无意中搜到了这个软件，由几个作者写成，第一作者还是华人，有点骄傲，可惜没有针对中国人或者东亚人的模型，只有世界和欧洲人的模型，瞬间又觉得有点失落，好在许多中国公司在积累了几万以上的数据后也开始进行中国人自己的模型构建,而且做得还不错）。
是个可以让你DIY分析你的基因组的网站，我的基因检测结果是没有提供impute(基因型填充)的，这个网站方便地进行了基因型填充，还有各个基因特征的预测，赞一个！我前面也介绍过，这个网站是开源的，使用R的shiny搭建。当然，这个基因型填 充是基于千人基因组计划进行的，数据结果估计不会像国内测了几十万人的准确。这里还有一个小插曲，前面我的原始结果并不是标准的23andme的，上传时并没有识别，作者还热心地联系我帮助我完成了分析，一并表示感谢。
如果你不懂代码，不懂网站规则，那么最简单的就是直接使用UCSC xena 浏览器啦！！！网站；https://xenabrowser.net/datapages/ 理论上也可以完成大部分数据探索的，甚至还有一些sci文章发表就是完完全全使用这个网页工具。