最近想要查找微生物中文名的时候发现一个宝藏R包，里面有2023年整理的拉丁名-中文名对照数据，于是心血来潮把表格保存了下来，分享一下，方便大家！公众号回复“中文名”，会给出文件链接！

R包简介

最早发现的是这个公众号推文微生物学名-中文名称转换（可批量）这篇推文应该是R包的作者写的吧！于是去他的github看了下，除了拉丁名-中文名对应这个包的“副业”，这个R包可以有很多很多的功能，多到作者整理了一本书，点赞呀！

pctax：用R分析组学数据，其旨在简化微生物组数据及其他组学数据集的分析，提供丰富的功能，促进生物信息学下游工作流程的发展。功能真的挺多的，看最近一次更新在6个月前，作者还在积极维护中。

表格保存的过程

就按照推文的方法，下载安装了R包之后，加载然后保存的。

devtools::install_git("https://ghfast.top/https://github.com/Asa12138/pctax")
library(pctax)
data("all_sp_la_zh_name")
head(all_sp_la_zh_name)
library(openxlsx)
write.xlsx(all_sp_la_zh_name, "all_sp_la_zh_name.xlsx")

当然，其中部分菌的名字有所调整的，表格中也有标注，这种一般是改名啦，示例如下：

名称来源

可能会有小伙伴担心名称的权威性怎样，数据来源是这里，这里看到推文介绍的是来自中国典型培养物保藏中心的原核微生物名称翻译及分类查询网站(http://cctcc.whu.edu.cn/portal/dictionary/index)，还是相当权威的，当然，最近几年感觉微生物的命名变化挺大，还是需要核实后使用呀！

看主要还是来自这本书《细菌名称双解及分类词典》。致敬致力于中文微生物分类的各位科学家呀！

参考：

• • https://github.com/Asa12138/pctax
• • https://bookdown.org/Asa12138/pctax_book/
• • https://mp.weixin.qq.com/s/dPDQwLQ5-U5f4gxZnjVa3Q
• • http://cctcc.whu.edu.cn/portal/dictionary/index
• • 《细菌名称双解及分类词典》