qiime2官方视频教程亮点回顾

做了一次搬运工,把 Qiime2 官方教程搬到了 B 站,B 站确实有机器的字幕,但是现阶段的 AI 字幕对于生物领域还是比较不友好的,特别是对于些专有名词,比如 qiime 直接翻译成 china。所以,未来每个人有个专属的工作 AI 助手应该是个未来的趋势啦!鉴于字幕不好, 我就每个视频把字幕校正了一遍,断断续续有半年多,终于理完啦!字幕重新上传了 B 站。当然,这也是一个学习的过程,大佬的讲解,让我也学到了不少,这里就选三个亮点分享一下!

首先是视频的网址先放这啦,阅读原文,即可开心观看!Introduction to the QIIME 2 Cancer Microbiome Intervention video tutorial[1]

带时间轴的 PCoA 图

25 Beta diversity visualizations[2]给了我一个新的 beta 多样性分析的维度,时间,当然,这需要 longitudinal 研究才可以,有没有被惊艳到。

机器学习

一直以为 qiime2 只是个基本的初级分析工具,应该没有相关插件进行机器学习分析,最后一课发现机器学习能力做得也挺棒的,可以直接用,降低了使用门槛,就不需要自己建模或者找第三方的包啦,给力!在 28 Sample classification 这一课,比较详细讲解了机器学习的简介,训练和效果评价,以及可能的坑。

漂亮的进化树

这个之前说过啦,这里就不再重复啦,移步这篇文章即可!漂亮的进化树

参考资料

[1]

1 Introduction to the QIIME 2 Cancer Microbiome Intervention video tutorial: https://www.bilibili.com/video/BV1GY4y1q7MD/?share_source=copy_web&vd_source=fb425d6f0ad40ac954b4bdf7090a013f

[2]

25 Beta diversity visualizations: https://www.bilibili.com/video/BV1uP411J7K7?spm_id_from=333.1245.0.0


本篇文章来源于微信公众号:微因

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