逛QIIME2论坛,发现北亚利桑那大学Gregory Caporaso教授(QIIME2的开发者),宣布Galaxy版的QIIME 2在线服务器可以用啦,如果有需要,用起来呀!当然,服务器在国外,可能小数据学习可行,大数据得自己本地分析呢,或者分析到表格再上传,会方便很多。QIIME 2现在可以通过公共Galaxy服务器访问(cancer.usegalaxy.org)。Galaxy是一个基于 Web 的平台,用于可访问、可重复和可扩展的生物医学数据分析。该Galaxy服务器由戈克斯实验室,俄勒冈健康与科学大学的癌症数据科学研究实验室。目前对服务器的使用方式没有限制,但如果需求超过其所能提供的范围,Goecks Lab 可能需要在某些时候限制存储和/或计算资源。
该产品是QIIME 2和Galaxy开发人员之间合作的结果,他们都由美国国家癌症研究所的癌症研究信息学技术程序。Galaxy还由国家人类基因组研究所和国家科学基金会资助。QIIME 2由Chan-Zuckerberg Initiative额外资助。我们感谢我们的资助者使这成为可能!
如果想了解更多关于通过Galaxy使用QIIME 2的信息,可以参考QIIME 2癌症微生物组干预教程,即可作为JupyterBook提供和相应的课程。还可以在运动图片教程的多界面版本。可以通过交互式教程了解有关Galaxy的更多信息,这些教程可通过Galaxy培训网并且可以在Galaxy帮助论坛上使用Galaxy获得帮助。
享受QIIME 2和Galaxy吧!QIIME 2 available on public galaxy server! – QIIME 2 Forum
Galaxy是由Galaxy团队在许多贡献者的支持下开发的。usegalaxy.org由Goecks实验室提供和维护,Goecks实验室是俄勒冈健康与科学大学的一个癌症数据科学研究实验室。银河系计划由NHGRI、NSF、哈克生命科学研究所、宾夕法尼亚州立大学网络科学研究所和约翰霍普金斯大学提供部分支持。
阅读原文,即可跳转这个在线服务器!
本篇文章来源于微信公众号:微因