最近手上有了一台新的红米笔记本16英寸,r7-4700u-16G的电脑,比起之前的thinkpad E431性能有了不小的提升,八核心八线程,多线程处理速度相比之前的双核4线程要强了不止两倍,虽然同样16DG的内存,频率也从1600MHz DDR3变为2600MHz了,别的不提,只16S降噪生成特征表的步步骤,速度就提升明显,八核心左右的运算任务,暂时就不需要再开云服务进行了。
还是获得16S物种丰度得老问题,最近在一台新机器上安装qiime1,发现有报错,对于这种停止维护的软件,也是正常现象吧,于是想别的办法解决,恰巧最近读R几本R语言的入门书,发现prop.table()这个函数是可以实现相关功能的,于是学习使用下。可能你早已会做这个啦,还是分享一下,看看有没有人需要。
直以来,看到这本书《Statistical Analysis of Microbiome Data with R》活跃在朋友圈和公众号,既然口碑这么好,当然有必要学习下啦!分享记录一下书中我所认为重要的点。
更新亮点都有啥呢?大概是几个命令和以前不一样了。