R语言包安装笔记 Y叔包yyplotr的艰辛安装

在Y叔的微信公众号看到了一个好久就想用的功能包,可以用来看文章发表趋势的,一直心痒,尝试了n次以后,终于安装成功了。这过程中有几个重要的点,需要记录下来:

1.github包的安装

在百度上找的代码已经过时了,虽然仅仅是符号的差别,但是还是挺不方便的,把我找到的代码放在这。

install.packages("devtools")
 library(devtools)
 install_github("GuangchuangYu/yyplot")

在百度上搜到的最后一步是以‘,’分隔的,包提示已经过时了,新的表示方法更加直观呀!另外就是缺什么包安什么包了,什么bioconductor, CRAN等。

bioconductor中科大源的使用:

source("https://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
 biocLite("magick")

听讲座得知R语言的一个开发者就是学生物的,开发完R就做了Bioconductor,厉害呀,膜拜!

2.Windows系统下的安装路径问题

在win下安装github包不知道为什么报错了说找不到命令(’G:\Program ‘ 不是内部或外部命令,也不是可运行的程序),我观察发现路径中有个空格,可能导致不识别,于是重新安装了R到其他不带空格的路径得以解决。

3.yyplot的试用

终于到了Y叔的yyplot登场了,测试一下,画了个研究生导师的文章发表趋势:

应该是有重名的,还是挺棒的,这么简单的包,赶紧用起来!

#用作者的示例加上我研究生阶段的课题
 library(yyplot) term <- c('"thiobencarb"') 
pm <- pubmed_trend(term, year=2001:2017) 
plot(pm)

课题不是怎么热哈!

版权属于作者( Y叔 biobabble),我只是个使用者,为了尊重作者,放上他的微信公众号二维码。

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