ASA芯片的探索

gsa芯片作为一款消费级基因检测市场上具有较高性价比的芯片，已经成为国内外多家基因检测公司的首选，不得不承认illumina的强大。毕竟，这是人家的看家本领，二代测序技术还是买来的呢。说句题外话，发现好多技术原创于英国，比如arm，纳米孔测序，sanger测序。。。最近，gsa芯片已经升级为ASA芯片，增加了许多位点，那么，我们来看下，ASA相比GSA的变化在哪呢？

首先还是统计一下asa的芯片位点在各个染色体上的分布情况。

dic = {}
with open('ASA-0-Consort__A1.csv') as f:
	for line in f:
		chromesome = line.strip().split(',')[9]
		#print(chromesome)
		#break
		if chromesome in dic.keys():
			dic[chromesome] += 1
		else:
			dic[chromesome] = 1

for chromesome in dic.keys():
	print(chromesome, dic[chromesome])

#结果是：

大概主要是增加了线粒体、Y染色体的位点，用于祖源分析吧！