HLA分型器
用芯片数据实现HLA分型
2020.2.12修复完成！再次提醒，娱乐水平，请勿用于其他用途，不做任何保证和承担任何责任。如果你的HLA分型比较罕见，那么准确率将低到离谱，也就是说如果你的祖源比较特别的话，不推荐使用。
2020.2.11发现运行脚本故障，紧急修复中。由于本人几乎没有前端和后台水平，所以应用相当简陋，请谅解。请把数据命名为邮箱地址.txt,如zd@163.com.txt 请选择并上传你的芯片数据文件（及扩展数据，可选）即可完成HLA分型。使用的建站gcloud进行的，配置只有单核1.6G，HLA分型器会耗时30min左右，请耐心等待,结束后以结果以邮件形式发送到你的邮箱.
是采用大神开发的snp2hla进行分型的，具体过程可参考我的博客：https://jiawen.zd200572.com/431.html
snp2hla是大名鼎鼎的Broad研究所开发的，通过snp分型数据来获得HLA分型信息的软件。它的准确度主要依赖于一个尽可能大的，针对特定民族人群的参考数据集。这个网页采用的是2014年发表的东亚人群的参考数据集，部分准确度约为80%。由于不同芯片的数据中HLA区域位点的数目不同，可能获得的结果有n多候选，请悉知。 下图是参考数据集的人数与各个基因座准确度的关系，可以看出，在400人左右的参考数据集时（这个网页采用的），准确度因基因座不同而不同。
做这个纯属个人爱好，原始数据和结果将在得出结果后删除。也可以按软件说明自己搞，也挺简单的。
又做了个R版本的，方法和准确度有区别，可以参考下，现在只能使用23andme数据，其他公司格式建议使用转换工具转成23andme格式后使用https://shiny.zd200572.com/HLA-HIBAG/ 其他公司格式转换工具，这里推荐一个：http://joshua.galaxy.42dna.com/wgto23/
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